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非洲猪瘟荧光定量PCR检测常见假阳性结果分析

时间:2020-11-06    点击: 次    来源:抗非大家谈    作者:赵和平 - 小 + 大

2. 选择性能良好的核酸提取仪和荧光定量PCR仪
大型的全自动化核酸提取仪设计时会引入分区设计、紫外防污染、层流防污染等措施,在选购核酸自动提取仪时应该考虑仪器的防污染性能。可以通过阴阳性样本交叉摆放,同时提取最大检测量的样本,来评估核酸提取仪的防污染性能。
关于荧光定量PCR仪的选择,某些仪器热盖设计存在严重缺陷,扩增结束后液体挥发严重,大量扩增产物泄漏,这种荧光定量PCR仪极易导致气溶胶污染。
3.选择带UNG酶防污染体系和内参的荧光定量PCR试剂盒
科学的试剂盒会引入UNG酶防污染体系,同时通过产品设计,保证PCR扩增效率。在降低气溶胶污染同时,保证检测的敏感性。
在荧光定量PCR扩增原料中不加TTP,只加UTP,扩增产物是含有UTP的核酸片段。UNG酶可以水解含有UTP的核酸片段,在扩增程序前添加UNG酶反应程序,可水解反应体系中含UTP的扩增产物,然后使用95℃高温灭活UNG酶,再运行荧光定量PCR反应程序,可以大幅度降低扩增产物气溶胶污染。
某些试剂盒附带的阳性对照浓度非常高(Ct值<25),频繁使用极易造成气溶胶污染。
使用带内参的荧光定量PCR试剂盒监控每个反应是否正常;使用弱阳性的样本(27<Ct值<35)作为阳性质控,监控提取和PCR反应的稳定性;尽量减少阳性对照的使用,可有效降低污染风险。
4. 荧光定量PCR应和普通PCR进行分区管理
某些检测中心针对相同的传染病检测,可能既开展荧光定量PCR检测,又开展普通PCR检测。如果普通PCR的扩增片段覆盖荧光定量PCR反应的扩增片段,则普通PCR的扩增产物极易污染荧光定量PCR检测系统。
5. 规范设计,改善PCR实验室环境
标准PCR实验室通常分为四个区(荧光定量PCR实验室无需产物分析区,分三个区),不同区域执行不同的实验操作(表1),中间品通过双扉传递窗单向传递。不同区域之间空气互相不流通,使用空调净化系统控制不同区域气压,形成压差,控制空气流向。每个区域设置缓冲间,缓冲间外部设置PCR实验室专用走廊(图1)。
表1 PCR实验室不同区域划分及功能特点

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