一、存在问题：
（一）、兽药执法体制不健全
1．执法机构不健全。目前大部分地区兽药行政管理部门没有专业执法机构。有的委托事业单位执法；有的自行组建临时性执法机构，配备部分兼职执法人员，但机构和人员属临时性质，没有编制，且执法不是其主要工作，影响了执法工作力度。
2．执法经费没有保障。一些地方由于财政困难，兽药行政执法经费没有列入财政预算，经费不足导致执法工具、手段落后，严重限制了兽药执法工作的正常开展。
3．处罚执行力度不强。目前处罚执行不到位和执法对象暴力抗法的现象经常发生，由于兽药管理部门自身受条件的限制，无法解决上述问题。另外由于执法范围限于本地，只能对本地的生产经营者实施监督管理。
（二）、不作为现象仍然存在
1．兽药行政许可方面。目前一些地方仍存在着办“兽药经营许可证”太难的问题，有好多完全符合法定条件、标准的申请人，却无法取得相关许可。
2．兽药行政处罚方面。省、市、县三级兽药行政执法部门中，级别越高每年办理的行政处罚案件越少，省市部门有的一年中没有行政处罚案件。
主要表现：一是没有积极履行法定职责，对管辖领域内的违法行为漠然处之，姑息放任，不去作为；二是不想承担责任，在行政执法检查中发现了问题责成县(市)、区相关部门处理，作为有罚没资格的执法主体不愿作为；三是政府职能转变不到位，管理部门和管理相对人还是“亲子”关系，不忍作为。
（三）、兽药行政处罚中存在事实不清、程序违法的现象
1．立案程序不规范。适用一般程序和听证程序的处罚案件应当履行立案程序。
2．调查取证不规范。调查取证是行政处罚的关键环节，必须全面、客观、公正，应该排除干扰，符合法定程序。
3.证据处理不规范。《行政处罚法》第三十七条对证据先行保存作出了明确规定，但在实际执法中，许多案件证据先行登记保存不履行审批程序，或不完整履行审批程序。
4．行政强制措施不规范。查封、扣押、冻结属行政强制措施，实际执法时有的超越法定权限，无任何依据而实施查封、扣押、冻结等强制措施；有的在实施中对查封、扣押的物品数量、质量不做详细记载，不向当事人交待查封扣押的时间、地点。
5．调查终结程序不规范。具体办案人员调查终结，应对案件的违法事实做出认定，同时根据法律依据提出处罚建议，报案件审核机构审核及领导审批，形成拟作处罚的意见。
6．事先告知不规范。只告知将给予行政处罚，而不告知处罚的具体种类和幅度。
7.处罚决定不规范。一是审批程序不规范。处罚决定审批有办案人意见，有机关领导审批意见，但缺少本机关法制机构审核意见；二是《行政处罚决定书》制作不规范。
8．文书送达不规范。处罚事先告知书、听证告知书不制作送达回证，是否送达说不清楚；被送达人拒签的，只有执法人员的签名，没有见证人的见证；邮寄送达的，不保留邮政部门的邮寄凭证；不在法定期限内送达、超出了“做出决定7日内送达”的法定期限。
9．行政处罚决定的执行不规范。一是没有结案报告；二是行政处罚决定是否执行没有相关证据，决定了没收违法物品没有处理方向(销毁、拍卖、移交等)；三是处罚决定与实际执行不符。非经法定事由和法定程序不能改变已经生效的行政决定。有的案卷中没有依法决定减免的相关材料，罚没票据的收缴数额大大低于行政处罚决定书的决定数额。
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